EOSC - un atout pour la recherche / an asset for science

Friday Apr 8, 2022, 1:30 PM → 5:00 PM Europe/Paris

Andy Gotz (ESRF), Brigitte Gagey (Synchrotron SOLEIL), Etienne Auge (Université Paris-Saclay), Jean-Francois Perrin (ESRF), Majid Ounsy (Synchrotron SOLEIL), Volker Beckmann (MESRI / DGRI / SSRI / A7)

         

La Commission Européenne a lancé l'initiative  European Open Science Cloud (EOSC) en 2015 dans le but de fournir aux chercheurs européens un accès transparent aux données et services. Depuis 2019 un grand nombre de projets œuvrent pour offrir à leur communauté scientifique des outils et plateformes pour adopter les bonnes pratiques de la Science Ouverte. PaNOSC et ExPaNDS sont les deux projets EOSC de la communauté Photons et Neutrons. Ce workshop, organisé par le MESRI, l'ESRF, SOLEIL, et l'ILL a pour but de montrer ou nous en sommes dans la réalisation de l'EOSC pour la communauté des Photons et Neutrons. Le workshop est destiné aux scientifiques et futurs utilisateurs de l'EOSC. Les intervenants sont principalement des scientifiques qui donneront leur vision de l'EOSC et ses atouts pour la science.

The European Commission launched the European Open Science Cloud (EOSC) initiative in 2015 with the aim of providing European researchers with transparent access to data and services. Since 2019 a large number of projects are working to provide their scientific community with tools and platforms to adopt Open Science best practices. PaNOSC and ExPaNDS are the two EOSC projects of the Photons and Neutrons community. This workshop, organized by MESRI, ESRF, SOLEIL, and ILL aims to show where we are in the realization of the EOSC for the Photon and Neutron community. The workshop is intended for scientists and future users of the EOSC. The speakers are mainly scientists who will give their vision of the EOSC and its assets for science.

Note: this event has been organised together with the French Ministry for Higher Education, Research and Innovation for the French scientific community, therefore a majority of talks was in French. Where the title of a talk is in English the presentation was also in English.

1 Introduction à EOSC

L'European Open Science Cloud (EOSC) vise à fournir aux chercheurs européens un accès transparent aux données, services et e-infrastructures FAIR. L'objectif est d'améliorer la productivité de la recherche en général. En tant que tel, l'EOSC est également un pilier de la transition numérique en France, qui comprend des efforts pour mutualiser les services et les e-infrastructures au profit de l'ensemble de la communauté de recherche. L'EOSC est le plus fort lorsqu'il répond directement aux besoins des communautés de recherche. Des projets comme PaNOSC et ExPaNDS ouvrent la voie vers un environnement de recherche Open Science. Ce type d'activités permet d'identifier les défis, de trouver des solutions et de fournir de bons exemples.

Speaker: Volker Beckmann (MESRI / DGRI / SSRI / A7)

2 PaNOSC & ExPaNDS : résultats des projets EOSC

Présentation des 2 projets de la communauté Photon et Neutrons avec une attention particulière aux résultats obtenus.

Speaker: Jean-François Perrin (ESRF)

3 FAIR Data

Within this topic the main dichotomy is between the two following categories: - (i) Raw (as well as processed and derived) data should underpin publications by the original experimental team and thereby FAIR including raw data is readily within reach. (ii) Raw data release to the public after an embargo period such as three years, where there was no publication by the original experimental team, is the second situation. This raises the fundamental question of “Just who does own the research data?” . Data control rules vary by world region, subject and funding agency; data management and sharing plans should be agreed before measurement. This talk will complement that of Andrew Thompson i.e. we will form a shared timeslot.

Speakers: Andy Thompson (SOLEIL), John R Helliwell (IUCr)

4 Reflections for FAIR data at a tomography beamline at SOLEIL

This talk will give a brief overview of tomography experiments at the PSICHE beamline, and the current pipeline for data management. Synchrotron tomography is a particularly demanding application in terms for computing. This raises a number of points for discussion about how to implement FAIR data management - in particular the amount of data produced, how that data is organised and stored, and the question of experiment specific metadata.

Speaker: Andrew King (SOLEIL)

5 Plateforme d'apprentissage pour la communauté

La plateforme de formation PaNOSC/ExPaNDS favorisant l'adoption des principes de la science ouverte et de l'innovation ouverte. Les infrastructures de recherche à grande échelle produisent quotidiennement des quantités massives de données scientifiques. Reconnaissant l'importance de favoriser la science ouverte et l'innovation ouverte, la CE a soutenu l'idée d'un nuage scientifique ouvert européen (EOSC) qui a pris forme en 2015. Dans la phase initiale de mise en œuvre, la CE a investi environ 250 millions d'euros pour prototyper des composants de l'EOSC par le biais d'appels à projets dans le cadre de H2020. Deux projets, PaNOSC et ExPaNDS, ont été financés pour développer le CEOS pour la communauté des photons et des neutrons (PaN). Les résultats de ces deux projets ont été la publication de données ouvertes, le développement de catalogues fédérés de données ouvertes, une infrastructure d'authentification et d'autorisation (AAI) communautaire prête pour l'EOSC, et des services pour l'analyse de données à distance, la simulation et une plateforme d'apprentissage en ligne. La formation des parties prenantes du PaN (bibliothécaires et gestionnaires de données, informaticiens, scientifiques et utilisateurs finaux, notamment industriels) au fonctionnement et à l'utilisation de ces nouvelles solutions est essentielle pour favoriser leur adoption et élargir la communauté PaN. PaNOSC/ExPaNDS fournit du matériel de formation accessible aux différents acteurs via une plateforme de formation innovante et un catalogue de formation.

Speaker: Ana Valcarcel-Orti (SOLEIL)

6 Pause 15 min

7 VISA, la plateforme d'analyse des données des infrastructures de recherche

Avec l'arrivée de VISA, un outil développé dans le cadre d'EOSC, L'ILL a changé ses méthodes d'accès aux données expérimentales : plus de flexibilité dans les équipes, une meilleure adaptation lors de la crise sanitaire et une simplification de l'utilisation des logiciels scientifiques. Nous présenterons ces changements et leurs avantages pour la science.

Speakers: Catarina Michelagnoli (ILL), Lucille Mangin-Thro (ILL)

8 Utilisation des notebooks Jupyter pour la diffraction de poudre

En réponse à l'augmentation de la vitesse d'acquisition des données offerte par l'EBS et corollairement, la diminution de la durée des expériences, l'ESRF a mis en place de nouveaux modes d'accès, en particulier les BAG (block allocation group): plusieurs groupes d'utilisateurs soumettent conjointement un seul projet, autour d'un même besoin instrumental, et se partage le temps de faisceau. L'un de ces BAGs offre à la communauté des sciences du patrimoine un accès régulier sur les lignes ID13 et ID22 pour l'analyse par diffraction des rayons X de matériaux historiques. La quantité de données générées toutes les 6 mois, le nombre d'utilisateurs impliqués (plus ou moins experts; sur site ou à distance), la stabilité des configurations expérimentales ont motivé l'optimisation d'outils simple d'utilisation, pour le traitement des données, notamment pour l'intégration azimutale des clichés de diffraction générés pendant les expériences de cartographie µXRD sur ID13: des "notebooks Jupyter". Leur principe et intérêts seront discutés, dans le contexte du BAG patrimoine.

Speaker: Marine Cotte (ESRF)

9 Logbook électronique pour les expériences

Le Logbook Électronique vu d’une ligne de lumière: pourquoi il a été mis en place en premier lieu, comment les confinements et les utilisateurs en accès à distance l’ont rendu incontournable (sur ID32 au moins), quels sont ses points forts et ses points faibles et comment le faire évoluer pour que tous nos utilisateurs s’en saisissent.

Speaker: Flora Yakhou (ESRF)

10 Aide à la création des DMPs pour les utilisateurs

Le Data Management Plan (DMP) est un document évolutif, permettant de décrire comment sont gérées les données et meta-données, au cours et une fois un projet terminé. Dans le contexte du projet PaNOSC, l'ESRF met en place un service, basé sur sa data policy, pour permettre aux utilisateurs de générer et compléter un DMP. Ce service utilise un outil existant, DS-Wizard. Un premier DMP a été produit à l'aide de ce service, pour le projet ANR MAGNIFIX.

Speakers: Marjolaine Bodin (ESRF), Nils Blanc (CNRS-MAGNIFIX)

11 Importance of FAIR data and data sharing

Speaker: Carlos Casorrán (European Commission / DG-RTD)

12 Table ronde: EOSC pour les communautés photon et neutron, quel avenir?

Speakers: Andrew Goetz (ESRF), Catarina Michelagnoli (ILL), Jean Susini (SOLEIL), Laurent Lellouch (CNRS), Lucille Mangin-Thro (ILL), Volker Beckmann (MESRI / DGRI / SSRI / A7)